Kao vodeća institucija za projektiranje i razvoj ratnih podvodnih i nadvodnih plovila u bivšoj Jugoslaviji, Brodarski institut je projektirao lake fregate klase Split te raketne topovnjače, ophodne i desantne brodove. Za potrebe Hrvatske ratne mornarice projektirane su raketne topovnjače Kralj Petar Krešimir lV. i Kralj Dmitar Zvonimir; diverzantske podmornice Velebit te novi protuminski brod. Projekti svih podmornica napravljeni su u Brodarskom institutu: klasa Heroj, klasa Sava i klasa Una.
Sve su to plovila koja predstavljaju tehnološki vrhunac u području ratne brodogradnje. Hrvatska se tako svrstava uz nekolicinu zemalja svijeta koja posjeduje vlastitu tehnologiju razvoja i gradnje podmornica te brodova za protuminsku borbu.

Ostajući predvodnikom razvoja domaće brodograđevne djelatnosti, Brodarski institut zadržava svoju tijesnu vezu s brodogradilištima i fakultetima surađujući na brojnim brodograđevnim projektima. Kao jedan od utemeljitelja Klastera male brodogradnje i kao nositelj njegove istraživačko-razvojne komponente, Brodarski institut razvija se u području nautičke proizvodnje projektiranjem i gradnjom jahti i plovila za sport i razonodu.

 

Doprinoseći razvoju hrvatske ribarske flote, Brodarski je institut projektirao više tipova ribarskih brodova koji se grade u hrvatskim brodogradilištima za domaće naručitelje. Obnova i modernizacija ribarske flote u Hrvatskoj važne su sastavnice Strategije razvoja ribarstva, a, sada, prvi put u svojoj povijesti gospodarenja Jadranom, Republika Hrvatska raspolaže modernom ribarskom flotom.